Lors de l’été 2026, entre ma deuxième et troisième année de cycle ingénieur à Polytech Paris-Saclay, j’ai eu l’opportunité d’effectuer un stage de mobilité internationale de 11 semaines à Oslo (Norvège).
J’ai intégré le Norwegian Centre for Molecular Biosciences and Medicine (NCMBM) à l’Université d’Oslo en tant que stagiaire en informatique.
Lors de ce stage, j’ai eu l’occasion de concevoir et développer le JASPAR Matrix Aligner, un outil bio-informatique.
Il aligne des motifs de liaison ADN fournis par l’utilisateur à ceux présents dans la base de données de référence JASPAR.
Cet outil génère un rapport détaillé au format HTML, avec notamment les scores d’alignement et les logos alignés des séquences.
Afin de le distribuer plus facilement, je l’ai publié avec Pixi (gestionnaire de paquets pour Python) et Docker.
Vous pouvez en apprendre plus sur cet outil via le lien suivant :
